绘制双变量LAVA分析结果的散点图
LAVA_bivarplot.Rd该函数用于根据LAVA双变量分析的结果，绘制散点图，并对结果进行可视化。
Usage
LAVA_bivarplot(
bivar_res = "./LAVA/bivar_res.csv",
fdr_method = "bonferroni",
color_low = "blue",
color_mid = "yellow",
color_high = "red",
color_midpoint = 0,
theme_base_size = 12,
x_axis_label_size = 10,
y_axis_label_size = 10,
ticks_size = 8,
plot_width = 8,
plot_height = 6,
save_name = "LAVA",
save_path = "./LAVA"
)Arguments
- bivar_res
字符串，LAVA双变量分析结果的文件路径，默认值为"./LAVA/bivar_res.csv"。
- fdr_method
字符串，FDR调整的方法，默认值为"bonferroni"。可选择的调整方法包括 "bonferroni", "hochberg", "hommel", "BH", "fdr" 等。
- color_low
字符串，低值区域的颜色，默认值为"blue"。
- color_mid
字符串，中间值区域的颜色，默认值为"yellow"。
- color_high
字符串，高值区域的颜色，默认值为"red"。
- color_midpoint
数值，渐变色的中点，默认值为0。
- theme_base_size
数值，图形主题的基本字体大小，默认值为12。
- x_axis_label_size
数值，x轴标签的字体大小，默认值为10。
- y_axis_label_size
数值，y轴标签的字体大小，默认值为10。
- ticks_size
数值，坐标轴刻度标签的字体大小，默认值为10。
- plot_width
数值，保存PDF的宽度，默认值为8。
- plot_height
数值，保存PDF的高度，默认值为6。
- save_name
字符串，保存PDF图形的文件名，默认值为"LAVA"。
- save_path
字符串，保存PDF文件的路径，默认值为"./LAVA"。