使用ldsc软件进行遗传相关性分析

软件官网：https://github.com/bulik/ldsc，使用前请先使用LDSC_py_install函数配置ldsc软件环境。

Usage

LDSC_py_rg(
  test_help = FALSE,
  Sumstatsfile = " ",
  ref_ld_chr = "./eur_w_ld_chr",
  w_ld_chr = "./eur_w_ld_chr",
  opt_arguments = NULL,
  save_name = " ",
  save_path = "./"
)

Arguments

test_help

是否调阅ldsc软件ldsc.py的帮助文档，默认FALSE。

Sumstatsfile

两个或多个.sumstats.gz格式文件路径，例如：c("./pgc_bip.sumstats.gz","./pgc_scz.sumstats.gz")。

ref_ld_chr

字符串，LD分数文件的目录路径，以 *.l2.ldscore.gz 结尾。

w_ld_chr

字符串，权重文件的目录路径。

opt_arguments

ldsc软件ldsc.py的其他命令行参数(设置test_help = TRUE查看参数)，默认NULL。

save_name

保存文件的文件名称。

save_path

文件保存路径。

Value

无返回值。