使用MAGMA进行交叉组织特异性分析

该函数通过MAGMA进行基因组和组织特异性分析，分析特定基因在不同组织的表达特征。 软件官网：https://cncr.nl/research/magma/。

Usage

MAGMA_Tissue_specific(
  genes_raw = "./UC/UC.genes.raw",
  gene_covar = "./gtex_v8_ts_avg_log2TPM.txt",
  save_name = "UC",
  save_path = "./UC"
)

Arguments

genes_raw

字符串，MAGMA_gene_based()函数分析生成的XXX.genes.raw文件路径，作为输入。

gene_covar

字符串，基因表达文件路径，下载地址：https://fuma.ctglab.nl/downloadPage，作为输入。

save_name

字符串，保存分析结果的文件名，默认值为"UC"。

save_path

字符串，保存分析结果的文件路径，默认值为"./UC"。

Value

data 返回分析结果数据。