使用MAGMA进行交叉组织特异性分析

软件官网：https://cncr.nl/research/magma/。

Usage

MAGMA_Tissue_specific(
  genes_raw = "./UC/UC.genes.raw",
  gene_covar = "./gtex_v8_ts_avg_log2TPM.txt",
  save_name = "UC",
  save_path = "./UC"
)

Arguments

genes_raw

MAGMA_gene_based()函数分析生成的XXX.genes.raw文件路径。

gene_covar

基因表达文件路径，下载地址：https://fuma.ctglab.nl/downloadPage。

save_name

保存结果的文件名。

save_path

保存结果的文件路径。

Value

data 分析结果数据。