MiXeR单变量分析可视化

使用MiXeR的mixer_figures.py脚本对单变量分析结果进行可视化。

Usage

MiXeR_Univariate_visualize(
  help = FALSE,
  json_fit = "./SCZ/SCZ_qc_noMHC.fit.rep@.json",
  mixer_py = "~/mixer/precimed/mixer_figures.py",
  statistic = "mean std",
  opt_arguments = NULL,
  save_name = "SCZ_Univariate_visualize",
  save_path = "./plot"
)

Arguments

help

逻辑型，是否显示帮助信息，默认为FALSE。

json_fit

字符型，指定fit1分析结果的JSON文件路径。例如"./SCZ/SCZ_qc_noMHC.fit.rep@.json"。

mixer_py

字符型，可视化脚本mixer_figures.py的路径，例如"~/mixer/precimed/mixer_figures.py"。

statistic

字符型，指定生成图表的统计指标，默认为"mean std"。

opt_arguments

字符型，可选参数，用于传递给mixer_figures.py combinefit分析的额外参数，默认为NULL。

save_name

字符型，保存文件的名称前缀。

save_path

字符型，指定图表保存的路径，默认为"./plot"。

Value

返回可视化分析结果的CSV数据。