将TwosampleMR格式转换成SUPERGNOVA分析输入格式数据

输出 .sumstats.gz 格式数据，包含表头：SNP、A1、A2、Z、N。

Usage

SUPERGNOVA_format_data(
  GWASfile = " ",
  N = NULL,
  save_name = " ",
  save_path = "./"
)

Arguments

GWASfile

字符串，标准的TwosampleMR格式数据文件路径。

N

数值，样本量。如果TwosampleMR格式数据中的 samplesize 列为 NA，需要补充该参数，默认值为 NULL。

save_name

字符串，指定输出文件的名称。

save_path

字符串，指定输出文件将保存的目录，默认值为当前工作路径。如果设置为 NULL，则不保存文件。

Value

返回数据框（data），包含转换后的分析输入数据。