Fusion 分析输入格式数据转换

该函数将标准的 TwosampleMR 格式的 GWAS 数据文件转换为 FUSION 软件所需的 .sumstats.gz 格式。输出文件包含 SNP、A1、A2、Z 和 N 等字段。转换后的数据将作为 FUSION 分析的输入。

FUSION 软件官网：FUSION Software。

Usage

TWAS_fusion_format_data(
  GWASfile = " ",
  N = NULL,
  save_name = " ",
  save_path = "./"
)

Arguments

GWASfile

字符串，GWAS 数据文件路径，要求为 TwosampleMR 格式的文件。

N

样本量，如果 TwosampleMR 格式数据中的 samplesize 列为 NA，需要提供该参数。默认值为 NULL。

save_name

字符串，输出文件的名称。默认值为 ""。

save_path

字符串，指定输出文件保存的目录，默认为当前工作目录。如果设置为 NULL，则不保存文件。

Value

data。