绘制MR分析森林图 — Visualizing_MR

绘制MR分析森林图

Usage

Visualizing_MR_forest(
  res,
  fdr_col = "fdr",
  ci_col = "#000000",
  ci_fill = "#000000",
  ci_lwd = 1,
  ci_sizes = 0.6,
  xlim = c(0, 3.5),
  ticks_at = c(0, 0.5, 1, 2, 3, 3.5),
  space_padding = 22,
  arrange_OR = FALSE,
  save_plot = FALSE,
  width = 8,
  height = 5,
  plot_pdf = "forest_plot",
  save_path = "./"
)

Arguments

res: 数据框，mr或xQTL_mr分析结果。
fdr_col: 字符串，经过多重检验矫正后的P值列名，默认值为"fdr"（若没有该列，不影响绘图）。
ci_col: 字符串，置信区间线的颜色，默认为"#000000"（黑色）。
ci_fill: 字符串，置信区间填充的颜色，默认为"#000000"（黑色）。
ci_lwd: 数值，置信区间线的粗细，默认为1。
ci_sizes: 数值，置信区间点的大小，默认为0.6。
xlim: 数值向量，x轴的范围，默认为c(0, 3.5)。
ticks_at: 数值向量，x轴上刻度标签的位置，默认为c(0, 0.5, 1, 2, 3, 3.5)。
space_padding: 数值，用于生成空格的值，默认为22。
arrange_OR: 布尔值，是否对森林图中的OR值进行降序排序，默认为FALSE。
save_plot: 布尔值，是否将图形保存为文件，默认为FALSE。
width: 数值，图形保存时的宽度，默认为8。
height: 数值，图形保存时的高度，默认为5。
plot_pdf: 字符串，图形保存的文件名，默认为"forest_plot"。
save_path: 字符串，保存图形的文件夹路径，默认为当前工作目录下的"./"。

Value

无直接返回值，生成并（如果save_plot为TRUE）保存一个森林图。