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注意:输入数据必须包含SNP数据的列名,函数将基于SNP的显著性阈值,查询Ensembl数据库以识别可能的混杂因素。

Usage

find_Confounders_ensembl(
  data,
  snp_col = "SNP",
  pval = 5e-08,
  save_path = "./",
  save_name = "Confounders"
)

Arguments

data

数据框,输入数据。必须包含SNP信息列。

snp_col

字符串,包含SNP标识符(例如rsid)的列名,默认为"SNP"。

pval

数字,SNP的显著性阈值,默认为5e-08。用于筛选显著的SNP。

save_path

字符串,结果保存路径,默认为当前目录("./")。

save_name

字符串,分析结果的文件名,默认为"Confounders"。

Value

数据框,包含分析结果的混杂因素数据。