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此函数METAL分析结果数据,格式化的数据保存为标准TwosampleMR、SMR文件。

Usage

format_data_METAL(
  GWASfile = " ",
  type = "outcome",
  samplesize,
  IVW_mode = "Multiplicative",
  min_pval = 1e-200,
  Twosample_dat = TRUE,
  SMR_dat = TRUE,
  save_name = " ",
  save_path = "./"
)

Arguments

GWASfile

指定METAL分析结果数据文件的路径。

type

Twosample数据类型,"exposure"或"outcome"默认为"outcome"。

samplesize

多个队列meta分析的总样本量。

IVW_mode

逆方差加权法-IVW分析模式,固定效应模型:"Fixed",随机效应模型:"Multiplicative"或"Additive"。

min_pval

允许的最小p值。默认为1e-200

Twosample_dat

TRUE或FALSE,是否保存Twosample数据文件。默认为TRUE。

SMR_dat

TRUE或FALSE,是否保存SMR数据文件。默认为TRUE。

save_name

指定输出文件名称。

save_path

指定输出文件将保存的目录,默认当前工作路径下。

Value

TwosampleMR格式数据。