将METAL分析结果数据格式转换

该函数将METAL分析结果数据进行格式化，并保存为标准的TwosampleMR、SMR、MTAG格式文件。

Usage

format_data_METAL(
  GWASfile = " ",
  type = "outcome",
  samplesize = 1000,
  IVW_mode = "Multiplicative",
  min_pval = 1e-200,
  chr_col = "CHR",
  pos_col = "BP",
  Twosample_dat = FALSE,
  SMR_dat = FALSE,
  MTAG_dat = FALSE,
  save_name = "meta",
  save_path = "./METAL"
)

Arguments

GWASfile

字符串，指定METAL分析结果数据文件的路径。注意：数据必须包含Freq1，否则自行使用format_dat()转换。

type

字符串，Twosample数据的类型，取值为"exposure"或"outcome"，默认为"outcome"。

samplesize

数值，多个队列meta分析的总样本量。

IVW_mode

字符串，逆方差加权法-IVW分析模式，支持"Fixed"（固定效应模型）、"Multiplicative"（乘法随机效应模型）或"Additive"（加法随机效应模型）。

min_pval

数值，允许的最小p值，默认为1e-200。

chr_col

字符串，可选填，表示染色体的列名。默认为"CHR"。

pos_col

字符串，可选填，表示坐标的列名。默认为"BP"。

Twosample_dat

逻辑值，指定是否保存TwosampleMR数据文件，默认为FALSE。

SMR_dat

逻辑值，指定是否保存SMR数据文件，默认为FALSE。

MTAG_dat

逻辑值，指定是否保存MTAG分析输入数据文件，默认为FALSE。。

save_name

字符串，指定输出文件的名称。

save_path

字符串，指定输出文件保存的目录路径，默认为当前工作目录。

Value

返回TwosampleMR格式的数据。