将METAL分析结果数据格式转换
format_data_METAL.Rd
此函数METAL分析结果数据,格式化的数据保存为标准TwosampleMR、SMR文件。
Usage
format_data_METAL(
GWASfile = " ",
type = "outcome",
samplesize,
IVW_mode = "Multiplicative",
min_pval = 1e-200,
Twosample_dat = TRUE,
SMR_dat = TRUE,
save_name = " ",
save_path = "./"
)
Arguments
- GWASfile
指定METAL分析结果数据文件的路径。
- type
Twosample数据类型,"exposure"或"outcome"默认为"outcome"。
- samplesize
多个队列meta分析的总样本量。
- IVW_mode
逆方差加权法-IVW分析模式,固定效应模型:"Fixed",随机效应模型:"Multiplicative"或"Additive"。
- min_pval
允许的最小p值。默认为
1e-200
。- Twosample_dat
TRUE或FALSE,是否保存Twosample数据文件。默认为TRUE。
- SMR_dat
TRUE或FALSE,是否保存SMR数据文件。默认为TRUE。
- save_name
指定输出文件名称。
- save_path
指定输出文件将保存的目录,默认当前工作路径下。