该函数通过本地文件读取方法,快速获取等位基因频率(EAF)值。适用于不需要联网时,快速计算暴露(exposure)或结局(outcome)数据的EAF值。该方法依赖于提供的参考频率文件,并根据SNP与参考频率数据的匹配结果进行校正。
Usage
get_EAF_local(dat, frq_path = " ", type = "exposure")
Arguments
- dat
数据框或列表,Twosample格式的暴露(exposure)或结局(outcome)数据。
- frq_path
字符串,参考频率文件路径,该文件包含SNP与等位基因频率信息(一般为频率文件fileFrequency.frq
)。
- type
字符串,数据类型,"exposure"表示暴露数据,"outcome"表示结局数据。默认为"exposure"。
Value
返回一个数据框,包含更新后的EAF值,及其匹配情况和校正类型。