Skip to contents

该函数从IEU数据库在线获取指定基因的顺式eQTL数据,并保存为标准格式文件。支持自定义上下游范围(cis_wind_kb)来指定顺式eQTL的提取范围。

Usage

get_ciseQTL_eQTLGen_Online(
  IEU_id = "ENSG00000270083",
  cis_wind_kb = 1000,
  save_path = "./"
)

Arguments

IEU_id

Ensembl ID或IEU数据库eqtl-a-的id号,如eqtl-a-ENSG00000270083。

cis_wind_kb

数值,顺式eQTL数据的上下游范围,单位为kb,默认1000kb(即1MB)。

save_path

字符串,指定保存输出文件的目录,默认为当前工作路径("./")。

Value

返回一个数据框,包含从IEU数据库获取的eQTLGen顺式eQTL数据,包含SNP、效应等信息。