get_ciseQTL_eQTLGen_Online.Rd
该函数从IEU数据库在线获取指定基因的顺式eQTL数据,并保存为标准格式文件。支持自定义上下游范围(cis_wind_kb)来指定顺式eQTL的提取范围。
get_ciseQTL_eQTLGen_Online( IEU_id = "ENSG00000270083", cis_wind_kb = 1000, save_path = "./" )
Ensembl ID或IEU数据库eqtl-a-的id号,如eqtl-a-ENSG00000270083。
数值,顺式eQTL数据的上下游范围,单位为kb,默认1000kb(即1MB)。
字符串,指定保存输出文件的目录,默认为当前工作路径("./")。
返回一个数据框,包含从IEU数据库获取的eQTLGen顺式eQTL数据,包含SNP、效应等信息。