在线获取"decode"或"ukb_ppp"的顺式pQTL数据 — get_cispQTL_decode_ukb_Online • QTLMR

在线获取"decode"或"ukb_ppp"的顺式pQTL数据

Usage

get_cispQTL_decode_ukb_Online(
  gene = " ",
  gene_ID = " ",
  resource = " ",
  cis_wind_kb = 1000,
  build = 38,
  save_name = " ",
  save_path = "./",
  SMR_data = TRUE
)

Arguments

gene: 基因名称或Ensemblid。
gene_ID: decode数据的SomaScan ID或ukb_ppp的OlinkID，分别通过函数data_info_decode_pQTL()、data_info_ukb_ppp_pQTL()查询。
resource: pQTL数据来源，"decode"或"ukb_ppp"。
cis_wind_kb: 指定顺式pQTL的上下游范围，默认1000kb，即1MB。。
build: 37或38，人类参考基因组版本，默认38。
save_name: 分析结果文件名，建议设置为基因名。
save_path: 基因pQTL数据保存路径，默认为当前文件夹"./"。
SMR_data: TRUE或FALSE，是否保存SMR分析输入数据文件，默认为TRUE。

Value

顺式pQTL数据。