在线获取fenland的顺式pQTL数据

在线获取fenland的顺式pQTL数据

Usage

get_cispQTL_fenland_Online(
  gene = " ",
  SomaScan_ids = " ",
  cis_wind_kb = 1000,
  build = 37,
  save_name = " ",
  save_path = "./",
  SMR_data = TRUE
)

Arguments

gene

基因名称或Ensemblid。

SomaScan_ids

SomaScan的ID号，通过函数data_info_fenland_pQTL()查询。

cis_wind_kb

指定顺式pQTL的上下游范围，默认1000kb，即1MB。

build

37或38，人类参考基因组版本，默认37。

save_name

分析结果文件名，建议设置为基因名。

save_path

基因pQTL数据保存路径，默认为当前文件夹"./"。

SMR_data

TRUE或FALSE，是否保存SMR分析输入数据文件，默认为TRUE。

Value

顺式pQTL数据。