在线获取Fenland的顺式pQTL数据 — get_cispQTL_fenland

该函数从Fenland项目在线获取指定基因的顺式pQTL数据。用户可以提供基因名称或Ensembl ID，并提供相关SomaScan ID号（通过函数data_info_fenland_pQTL()查询）。此外，用户可以自定义顺式pQTL的上下游范围（cis_wind_kb），并选择是否保存SMR分析输入数据文件。

Usage

get_cispQTL_fenland_Online(
  gene = " ",
  SomaScan_ids = " ",
  cis_wind_kb = 1000,
  build = 37,
  save_name = " ",
  save_path = "./",
  SMR_data = TRUE
)

Arguments

gene: 字符串，指定基因名称或Ensembl ID。
SomaScan_ids: 字符串，指定SomaScan的ID号，需通过函数data_info_fenland_pQTL()查询。
cis_wind_kb: 数值，指定顺式pQTL的上下游范围，单位为kb，默认为1000kb（即1MB）。
build: 数值，指定人类参考基因组版本，支持37（GRCh37）或38（GRCh38），默认为37。
save_name: 字符串，指定分析结果文件名，建议设置为基因名。
save_path: 字符串，指定保存pQTL数据文件的路径，默认为当前工作路径（"./"）。
SMR_data: 逻辑值，是否保存SMR分析输入数据文件，默认为TRUE。

Value

返回一个数据框，包含从Fenland项目获取的顺式pQTL数据，包含SNP、效应、p值等信息。