本地数据提取结局数据并基于LDlink代理SNP — modified_Proxy_SNP_LDlink • QTLMR

该函数通过LDlink数据库，基于给定的暴露数据和结局数据，寻找与目标SNP相关的代理SNP。支持设置连锁不平衡（r2）阈值，指定暴露和结局数据的人类基因组版本（grch37或grch38），以及选择特定人群种族（如EUR，指欧洲人群）进行分析。

Usage

modified_Proxy_SNP_LDlink(
  exposure_dat,
  outcome_dat,
  r2 = 0.8,
  pop = "EUR",
  build_exposure = "grch37",
  build_outcome = "grch37"
)

Arguments

exposure_dat: TwoSampleMR格式的暴露数据，包含暴露变量与其对应的SNP信息。
outcome_dat: TwoSampleMR格式的完整结局数据，包含结局变量与其对应的SNP信息。
r2: 代理SNP连锁不平衡（r2）阈值，用于筛选符合要求的代理SNP，默认为0.8。r2越高，说明两个SNP的连锁关系越强。
pop: 人群种族，默认为"EUR"（欧洲人群）。可选择其他人群，如"AFR"（非洲人群）等。
build_exposure: 需指定暴露数据参考的人类基因组版本，选择"grch37"或"grch38"。默认值为"grch37"。
build_outcome: 需指定结局数据参考的人类基因组版本，选择"grch37"或"grch38"。默认值为"grch37"。

Value

返回处理后的数据，包括暴露和结局数据中与给定SNP相关的代理SNP。