本地数据提取结局数据并基于LDlink代理SNP — modified_Proxy_SNP_LDlink • QTLMR

本地数据提取结局数据并基于LDlink代理SNP

Usage

modified_Proxy_SNP_LDlink(
  exposure_dat,
  outcome_dat,
  r2 = 0.8,
  pop = "EUR",
  build_exposure = "grch37",
  build_outcome = "grch37"
)

Arguments

exposure_dat: TwoSampleMR格式暴露数据。
outcome_dat: TwoSampleMR格式完整结局数据。
r2: 代理SNP连锁不平衡r2阈值。
pop: 人群种族,默认为"EUR"。
build_exposure: 需指定暴露数据参考的人类基因组类型,"grch37"或"grch38"。
build_outcome: 需指定结局数据参考的人类基因组类型,"grch37"或"grch38"。

Value

data