本地数据harmonise并基于Ensembl数据库代理SNP

本地数据harmonise并基于Ensembl数据库代理SNP

Usage

modified_harmonise_proxy_Ensembl(
  exposure_dat,
  outcome_dat,
  num = 1,
  r2_thershold = 0.8,
  build = "37",
  pop = "EUR",
  save_path = "./",
  save_name = "harmonise_dat"
)

Arguments

exposure_dat

TwosampleMR格式暴露数据。

outcome_dat

TwosampleMR格式结局数据。

num

代理SNP数目的起始位置。

r2_thershold

代理SNP连锁不平衡r2过滤阈值，默认0.8。

build

需指定暴露数据参考的人类基因组类型,"37"或"38"

pop

人群种族,默认为"EUR"。

save_path

数据保存路径，默认为当前文件夹"./"。

save_name

分析结果文件名。

Value

data