chrpos转rsid

此函数基于SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37与SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38，请预先安装包至本地。

Usage

tran_SNP_from_chrpos(
  GWASfile = " ",
  chr_col = "chromosome",
  pos_col = "base_pair_location",
  build = 37,
  save_path = "./",
  save_name = " "
)

Arguments

GWASfile

需要转换的GWAS数据文件路径。

chr_col

数据中包含染色体序号的列名。

pos_col

数据中包含坐标的列名。

build

人类参考基因组的版本，37或38，默认37。

save_path

指定输出文件将保存的目录，默认当前工作路径下。

save_name

分析结果保存文件名。

Value

data