绘制xQTL森林图(Forest Plot)
xQTL_forest.Rd
绘制xQTL森林图(Forest Plot)
Arguments
- res
mr或xQTL_mr分析结果。
- pvalsig
用于筛选显著结果的参数,默认值为NULL,若为"pval"或"fdr"则按照对应的p值或FDR值<0.05筛选。
- ci_col
置信区间线的颜色,默认为"#000000"(黑色)。
- ci_fill
置信区间填充的颜色,默认为"#000000"(黑色)。
- ci_lwd
置信区间线的粗细,默认为1。
- xlim
x轴的范围,默认为c(0, 3.5)。
- ticks_at
x轴上刻度标签的位置,默认为c(0, 0.5, 1, 2, 3, 3.5)。
- arrange_OR
是否对森林图的OR值进行降序排序,默认为TRUE。
- arrange_expnm
是否对森林图的基因名称安装首字母进行排序,默认为FALSE(若需执行,设置arrange_OR = FALSE,arrange_expnm =TRUE)。
- save_plot
是否保存图形为文件,默认为FALSE。
- plot_pdf
图形保存的文件名,默认为"forest_plot"。
- width
图形保存时的宽度,默认为8。
- height
图形保存时的高度,默认为5。
- save_path
保存图形的文件夹路径,默认为当前工作目录下的"./"。