绘制xQTL孟德尔随机化结果火山图 — xQTL_volcano_plot • QTLMR

此函数只需要xQTL_mr计算PVE。

Usage

xQTL_volcano_plot(
  dat,
  breaks = c(0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5),
  scale_color = c("green", "grey", "red"),
  FDR_method = "fdr",
  save_plot = TRUE,
  pdf_name = "volcano_plot",
  width = 6,
  height = 5,
  save_path = "./"
)

Arguments

dat: xQTL分析后的结果数据。
breaks: PVE刻度大小。
scale_color: 火山图气泡颜色设置，默认c("green", "grey","red")。
FDR_method: FDR矫正方法，默认"fdr",其它方法详见p.adjust函数的method参数。
save_plot: TRUE或FALSE，是否保存火山图，默认为TRUE。
pdf_name: 保存的pdf图形文件名，默认plot。
width: 图形宽度。
height: 图形高度。
save_path: 图形文件保存路径，默认"./"。

Value

fdr矫正结果